wps_supplicant запущен из коробки в образе XFCE в виртуальной машине. systemctl status wpa_supplicant показывает, что сервис disabled, но он работает, значит включение произошло при запросе к его dbus-интерфейсу fi.w1.wpa_supplicant1. Возможно, в него постучался NetworkManager, но точно ли ему нужно постоянно работать в фоне?! Особенно на сервере!
Хотя в сервере вроде нет его. Может, nm-applet графический виноват